Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AC190387.1-201ENST00000551683 408 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 CADPS2-202ENST00000334010 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 NQO2-203ENST00000380441 1021 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
ASCL3Q9NQ33 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms