Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPI8

FANCF, Fanconi anemia group F protein, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCFQ9NPI8 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 ARHGEF40-201ENST00000298694 5919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FANCFQ9NPI8 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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