Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP66

HMG20A, High mobility group protein 20A, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMG20AQ9NP66 XK-201ENST00000378616 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 LZTS1-202ENST00000381569 5706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
HMG20AQ9NP66 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
HMG20AQ9NP66 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms