Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCS2

CYP4F12, Cytochrome P450 4F12, humanhuman

Predictions only

Length 524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP4F12Q9HCS2 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
CYP4F12Q9HCS2 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms