Protein–RNA interactions for Protein: Q9HAB3

SLC52A2, Solute carrier family 52, riboflavin transporter, member 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC52A2Q9HAB3 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 AC068594.1-203ENST00000581153 695 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SLC52A2Q9HAB3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SLC52A2Q9HAB3 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms