Protein–RNA interactions for Protein: Q9H6B4

CLMP, CXADR-like membrane protein, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMPQ9H6B4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 AC007364.1-201ENST00000449714 1022 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
CLMPQ9H6B4 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 TRIM36-202ENST00000379617 1322 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
CLMPQ9H6B4 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.5 ms