Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 MMP23A-201ENST00000234610 1017 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CLSTN2Q9H4D0 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CLSTN2Q9H4D0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86 ms