Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 SPECC1-203ENST00000395525 2536 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
BHLHE41Q9C0J9 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 LAMC1-201ENST00000258341 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
BHLHE41Q9C0J9 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms