Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZE2

PUS3, tRNA pseudouridine(38/39) synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUS3Q9BZE2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 ODF3B-204ENST00000405135 917 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 AC108073.2-201ENST00000464002 357 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PUS3Q9BZE2 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
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