Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYJ9

YTHDF1, YTH domain-containing family protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF1Q9BYJ9 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
YTHDF1Q9BYJ9 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 TSSC2-204ENST00000529482 2337 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
YTHDF1Q9BYJ9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms