Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD9

ACTRT3, Actin-related protein T3, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTRT3Q9BYD9 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTRT3Q9BYD9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTRT3Q9BYD9 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTRT3Q9BYD9 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTRT3Q9BYD9 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTRT3Q9BYD9 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTRT3Q9BYD9 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTRT3Q9BYD9 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ACTRT3Q9BYD9 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 FAM20A-205ENST00000592554 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
ACTRT3Q9BYD9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms