Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AKR1C7P-201ENST00000305623 895 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
RAB11FIP5Q9BXF6 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.4 ms