Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXE9

VN1R3, Vomeronasal type-1 receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VN1R3Q9BXE9 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AL356481.3-201ENST00000630523 575 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
VN1R3Q9BXE9 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms