Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW72

HIGD2A, HIG1 domain family member 2A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD2AQ9BW72 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 FUOM-201ENST00000278025 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 C9orf139-202ENST00000623196 4990 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 HEMK1-201ENST00000232854 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
HIGD2AQ9BW72 C12orf56-207ENST00000543942 3242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.1 ms