Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NUP58Q9BVL2 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 SMARCA4-215ENST00000590574 5282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 PARK7-201ENST00000338639 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NUP58Q9BVL2 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.4 ms