Protein–RNA interactions for Protein: Q9BV40

VAMP8, Vesicle-associated membrane protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP8Q9BV40 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 PHF14-215ENST00000634607 3407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 BTNL9-210ENST00000515271 1444 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 ARL8B-208ENST00000611208 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 MYLK-201ENST00000346322 5892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 FLI1-201ENST00000281428 4151 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 PDE4D-203ENST00000340635 8232 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
VAMP8Q9BV40 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms