Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUI4

POLR3C, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR3CQ9BUI4 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
POLR3CQ9BUI4 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms