Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 SAMD11-215ENST00000618779 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
PAGR1Q9BTK6 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms