Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW8

NIPSNAP1, Protein NipSnap homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPSNAP1Q9BPW8 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 CTNNAL1-201ENST00000325551 2490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
NIPSNAP1Q9BPW8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NIPSNAP1Q9BPW8 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.6 ms