Protein–RNA interactions for Protein: Q99708

RBBP8, DNA endonuclease RBBP8, humanhuman

Predictions only

Length 897 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP8Q99708 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 PRDM5-203ENST00000428209 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
RBBP8Q99708 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RBBP8Q99708 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms