Protein–RNA interactions for Protein: Q96QF0

RAB3IP, Rab-3A-interacting protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB3IPQ96QF0 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PTPN21-201ENST00000328736 6089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 MBNL1-202ENST00000282488 6458 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RAB3IPQ96QF0 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms