Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q04

LMTK3, Serine/threonine-protein kinase LMTK3, humanhuman

Predictions only

Length 1,460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMTK3Q96Q04 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AC020659.2-202ENST00000512295 513 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AC106772.2-201ENST00000515085 442 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMTK3Q96Q04 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms