Protein–RNA interactions for Protein: Q96MW1

CCDC43, Coiled-coil domain-containing protein 43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC43Q96MW1 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
CCDC43Q96MW1 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 PROSER2-201ENST00000277570 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
CCDC43Q96MW1 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.1 ms