Protein–RNA interactions for Protein: Q96MT7

CFAP44, Cilia- and flagella-associated protein 44, humanhuman

Predictions only

Length 982 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP44Q96MT7 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CFAP44Q96MT7 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms