Protein–RNA interactions for Protein: Q96M94

KLHL15, Kelch-like protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL15Q96M94 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 OPRK1-205ENST00000612786 5196 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
KLHL15Q96M94 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms