Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ0

DCHS1, Protocadherin-16, humanhuman

Predictions only

Length 3,298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCHS1Q96JQ0 GTSF1-201ENST00000305879 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 GABARAPL2-202ENST00000563744 791 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 RAC2-203ENST00000405484 842 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 AF274855.1-203ENST00000424126 800 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
DCHS1Q96JQ0 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
DCHS1Q96JQ0 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms