Protein–RNA interactions for Protein: Q96E29

MTERF3, Transcription termination factor 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 417 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTERF3Q96E29 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CPT2-208ENST00000636891 2746 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
MTERF3Q96E29 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
MTERF3Q96E29 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms