Protein–RNA interactions for Protein: Q96CS3

FAF2, FAS-associated factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAF2Q96CS3 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 AHSA2-202ENST00000394457 6574 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAF2Q96CS3 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAF2Q96CS3 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms