Protein–RNA interactions for Protein: Q96C92

SDCCAG3, Serologically defined colon cancer antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDCCAG3Q96C92 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 EFEMP2-210ENST00000528176 1504 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 SNAPC3-207ENST00000610884 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 CYB561D1-205ENST00000430195 5077 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SDCCAG3Q96C92 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms