Protein–RNA interactions for Protein: Q969G5

CAVIN3, Caveolae-associated protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN3Q969G5 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CAVIN3Q969G5 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms