Protein–RNA interactions for Protein: Q92837

FRAT1, Proto-oncogene FRAT1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRAT1Q92837 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
FRAT1Q92837 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms