Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 CYSRT1-201ENST00000409414 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
TOPBP1Q92547 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
TOPBP1Q92547 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms