Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 HNRNPUL1-203ENST00000378215 2864 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 NEXN-AS1-201ENST00000421331 2292 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SMPDL3AQ92484 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms