Protein–RNA interactions for Protein: Q8WX93

PALLD, Palladin, humanhuman

Predictions only

Length 1,383 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALLDQ8WX93 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AL022068.1-202ENST00000432171 794 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PALLDQ8WX93 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.33■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PALLDQ8WX93 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms