Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFY4

SEMA6D, Semaphorin-6D, humanhuman

Predictions only

Length 1,073 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA6DQ8NFY4 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 HARS-201ENST00000307633 1780 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SEMA6DQ8NFY4 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms