Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 GOLGA6L10-207ENST00000610657 1705 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PIK3C3Q8NEB9 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
PIK3C3Q8NEB9 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms