Protein–RNA interactions for Protein: Q8N271

PROM2, Prominin-2, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROM2Q8N271 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 AKAP8P1-201ENST00000434743 1349 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 AC106772.1-201ENST00000506629 591 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 FAM212B-207ENST00000534365 1217 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 AC069120.2-201ENST00000524091 540 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PROM2Q8N271 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PROM2Q8N271 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms