Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 HEY1-208ENST00000523976 1325 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 PTPA-213ENST00000419582 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 ARSEP1-201ENST00000420443 635 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 U91328.1-201ENST00000437528 223 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 TEX12-201ENST00000280358 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 ETV4-201ENST00000319349 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 SNHG11-207ENST00000434729 1058 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
PTF1AQ7RTS3 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
PTF1AQ7RTS3 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms