Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
HECW1Q76N89 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 PTGES3-205ENST00000456859 957 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
HECW1Q76N89 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms