Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY6

WDR88, WD repeat-containing protein 88, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR88Q6ZMY6 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 CDK11B-209ENST00000629312 2496 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
WDR88Q6ZMY6 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 CCDC177-201ENST00000599174 4131 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
WDR88Q6ZMY6 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms