Protein–RNA interactions for Protein: Q6PI97

C11orf88, UPF0722 protein C11orf88, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf88Q6PI97 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 WNT1-201ENST00000293549 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 LMX1B-201ENST00000355497 5809 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
C11orf88Q6PI97 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms