Protein–RNA interactions for Protein: Q5W0B7

TMEM236, Transmembrane protein 236, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM236Q5W0B7 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AGFG1-201ENST00000310078 8668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 NUTM2F-201ENST00000253262 2561 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
TMEM236Q5W0B7 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms