Protein–RNA interactions for Protein: Q5TGI4

SAMD5, Sterile alpha motif domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD5Q5TGI4 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 AC034105.1-201ENST00000563488 319 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
SAMD5Q5TGI4 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms