Protein–RNA interactions for Protein: Q5T6F2

UBAP2, Ubiquitin-associated protein 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBAP2Q5T6F2 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 ADGRG3-202ENST00000450388 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 SLC6A2-209ENST00000568943 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 MYD88-211ENST00000495303 976 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
UBAP2Q5T6F2 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms