Protein–RNA interactions for Protein: Q5M9N0

CCDC158, Coiled-coil domain-containing protein 158, humanhuman

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC158Q5M9N0 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CCDC158Q5M9N0 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CCDC158Q5M9N0 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms