Protein–RNA interactions for Protein: Q567U6

CCDC93, Coiled-coil domain-containing protein 93, humanhuman

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Length 631 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC93Q567U6 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 LRRC20-205ENST00000395010 2959 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
CCDC93Q567U6 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CCDC93Q567U6 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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