Protein–RNA interactions for Protein: Q53GQ0

HSD17B12, Very-long-chain 3-oxoacyl-CoA reductase, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSD17B12Q53GQ0 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
HSD17B12Q53GQ0 ZNF79-204ENST00000617266 1969 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
HSD17B12Q53GQ0 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms