Protein–RNA interactions for Protein: Q53FE4

C4orf17, Uncharacterized protein C4orf17, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4orf17Q53FE4 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AC005225.4-201ENST00000557330 545 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 C3orf14-202ENST00000462069 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AL359881.2-201ENST00000602973 570 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 PTH2R-204ENST00000617735 2472 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
C4orf17Q53FE4 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms