Protein–RNA interactions for Protein: Q2NKQ1

SGSM1, Small G protein signaling modulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGSM1Q2NKQ1 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
SGSM1Q2NKQ1 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
SGSM1Q2NKQ1 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms