Protein–RNA interactions for Protein: Q2M243

CCDC27, Coiled-coil domain-containing protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC27Q2M243 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC27Q2M243 FGFR1-203ENST00000341462 6054 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC27Q2M243 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms